
A Dirección do Campus Auga, que exerce as tarefas de responsabilidade da coordinación e do funcionamiento do Campus, está asesorada polo Comité Executivo, que se estrutura en catro áreas aliñadas cos ámbitos estratéxicos de actividade do Campus Auga: Docencia; Investigación; Transferencia; Internacionalización, e está integrado por un máximo de catro membros do Personal Docente e Investigador (PDI) da Universidade de Vigo.
O Campus Auga proxéctase desde o Campus de Ourense, integrando na súa estrutura organizativa, os recursos e capacidades dispoñibles nas distintas unidades nas que se desenvolve a súa actividade docente, investigadora e de transferencia. Para reforzar a visibilización da súa identidade propia como campus especializado, erixiuse o Edificio Campus Auga como a súa nova infraestrutura de referencia dentro da Universidade de Vigo. Nesta infraestrutura, que constitúe a súa sede institucional, sitúanse: i) a Dirección, responsable da coordinación e funcionamento do Campus, ii) a Unidade Técnica de Xestión, que organiza e executa as actuacións do Campus Auga, iii) as Infraestruturas científicas (11) e, iv) os servizos de soporte do edificio.